Финансисты в ответе на запрос плательщика налогов о употреблении вычетов сумм НДС объяснили, что товары, приобретённые в долг, возможно принять к вычету по НДС по общим правилам. Одновременно с этим товары, приобретённые на средства бюджета, нельзя принять к вычету, так каким образом это послужит причиной к двойному компенсированию налога (письмо Департамента налоговой и таможенной политики Министерства финансов Российской Федерации от 31 августа 2016 г. № 03-07-11/50730 "О употреблении вычетов сумм НДС, предоставленных отчуждателями товаров (работ, услуг)").

Отметим, что при исчислении суммы НДС, подлежащей оплате в бюджет, плательщик налогов в праве ее снизить на суммы налога по товарам (работам, услугам) и имущественным правам, получаемым для осуществления операций, подлежащих налогообложению НДС, либо для продажи (п. 1 и 2 ст. 171 НК РФ). Вычеты сумм НДС производятся на базе счетов-фактур после принятия на учет данных товаров (работ, услуг) и имущественных прав (п.1 ст. 172 НК РФ).
По этому правилу возможно принять к вычету по НДС и товары (работы, услуги), уплачиваемые за счет средств, получаемых по кредитным соглашениям с банками. При таких обстоятельствах никаких ограничений по источнику финансовых средств в законе не определено.
Одновременно с этим, в случае если товары (работы, услуги) приобретаются за счет средств бюджета (субсидий), то суммы НДС оплачиваются отчуждателям за счет средств этого бюджета. Следовательно принятие их к вычету (компенсированию) послужит причиной к повторному компенсированию налога из бюджета. Исходя из этого в случае получения субсидий на компенсирование расходов, связанных с уплатой купленных товаров (работ, услуг), суммы НДС, раньше принятые к вычету по таким товарам (работам, услугам), следует вернуть.